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　　熒光定量PCR儀所用到的實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是通過(guò)對PCR擴增反應中每一個(gè)循環(huán)產(chǎn)物熒光信號的實(shí)時(shí)檢測，而實(shí)現對起始模板定量及定性分析的目的。在實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應中，引入了一種熒光化學(xué)物質(zhì)，隨著(zhù)PCR反應的進(jìn)行，PCR反應產(chǎn)物不斷累計，熒光信號強度也等比例增加。每經(jīng)過(guò)一個(gè)循環(huán)，收集一個(gè)熒光強度信號，這樣就可以通過(guò)熒光強度變化監測產(chǎn)物量的變化，從而得到一條熒光擴增曲線(xiàn)圖，達到監測PCR產(chǎn)物擴增量的目的。

　　一般而言，熒光擴增曲線(xiàn)可以分成三個(gè)階段：熒光背景信號階段、熒光信號指數擴增階段和平臺期。在熒光背景信號階段，擴增的熒光信號被熒光背景信號所掩蓋，無(wú)法判斷產(chǎn)物量的變化；而在平臺期，擴增產(chǎn)物已不再呈指數級增加，PCR的終產(chǎn)物量與起始模板量之間沒(méi)有線(xiàn)性關(guān)系，因此根據最終的PCR產(chǎn)物量不能計算出起始DNA拷貝數。只有在熒光信號指數擴增階段，PCR產(chǎn)物量的對數值與起始模板量之間存在線(xiàn)性關(guān)系，故選擇該階段進(jìn)行定量分析。為了較方便的進(jìn)行DNA拷貝數的定量，在實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)中引入了三個(gè)非常重要的概念：基線(xiàn)、熒光閾值和Ct值。

　　熒光定量PCR儀的實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是DNA定量技術(shù)的一次飛躍。運用該項技術(shù)我們可以對DNA、RNA樣品進(jìn)行定量和定性分析。定量分析包括絕對定量分析和相對定量分析。前者可以得到某個(gè)樣本中基因的拷貝數和濃度；后者可以對不同方式處理的兩個(gè)樣本中的基因表達水平進(jìn)行比較。